目的探讨长链非编码RNA肿瘤易感性候选基因9(lncRNA CASC9)、YKT6在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中表达意义及预后价值。方法选取2016年1月至2018年1月在陕西中医药大学附属医院诊治的110例OSCC患者作为研究对象。采用实时荧光定量PCR法检测患者OSCC癌组织及癌旁组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达。采用免疫组化检测OSCC癌组织及癌旁组织YKT6蛋白表达。Kaplan-Meier曲线分析不同lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达对OSCC患者预后的影响。Cox回归模型分析影响OSCC预后的因素。结果OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达分别为3.12±0.57、2.69±0.42，均明显高于癌旁组织（依次为1.02±0.25、1.13±0.21），差异有统计学意义(t=35.386、34.843，P＜0.05)。OSCC癌组织YKT6蛋白阳性率为81.82%（90/110），高于癌旁组织［9.09%（10/110）］，差异有统计学意义(χ 2=117.333，P＜0.05)。OSCC癌组织lncRNA CASC9与YKT6 mRNA表达呈正相关(r=0.788，P＜0.001)。TNM分期Ⅲ～Ⅳ期、低分化及有淋巴结转移的OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达高于TNM分期Ⅰ～Ⅱ期、高中分化及无淋巴结转移的OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达，差异有统计学意义（均P<0.05）。lncRNA CASC9高表达组、YKT6 mRNA高表达组5年累积生存率低于lncRNA CASC9低表达组、YKT6 mRNA低表达组，差异有统计学意义（Log-rank χ 2=7.080、8.741，P=0.008、0.003）。lncRNA CASC9高表达、YKT6 mRNA高表达、TNM分期Ⅲ～Ⅳ期、低分化及有淋巴结转移是OSCC患者预后危险因素。结论OSCC癌组织中lncRNA CASC9、YKT6表达升高，两者可作为评估OSCC患者预后的肿瘤标志物。