目的探究食管鳞癌组织OTU去泛素酶3（OTUD3）、白细胞介素增强结合因子2(ILF2)表达与临床病理特征及预后的关系。方法选取2019年1月至2020年7月在淮安市第五人民医院行食管癌根治术治疗的102例食管鳞癌患者作为研究对象。应用免疫组织化学检测组织OTUD3、ILF2表达。Spearman秩相关分析食管鳞癌中OTUD3与ILF2表达的关系。Kaplan-Meier生存曲线分析OTUD3、ILF2表达对食管鳞癌预后的影响。COX比例风险模型分析食管鳞癌预后影响因素。结果与癌旁组织相比，食管鳞癌组织中OTUD3阳性率较低，ILF2阳性率较高，差异均有统计学意义（P＜0.05）。癌组织中OTUD3和ILF2表达呈负相关（r=-0.712，P＜0.001）。相比于TNM分期Ⅰ～Ⅱ期、中高分化程度、无淋巴结转移食管鳞癌患者，TNM分期Ⅲ期、低分化程度、有淋巴结转移食管鳞癌患者组织OTUD3阳性率较低，ILF2阳性率较高，差异有统计学意义（P＜0.05)。OTUD3阳性组患者3年累积生存率高于OTUD3阴性组，差异有统计学意义(Log-rank χ 2=5.869,P=0.015)；ILF2阳性组患者3年累积生存率低于ILF2阴性组，差异有统计学意义(Log-rank χ 2=16.257，P＜0.001)。TNM分期、淋巴结转移、分化程度、OTUD3及ILF2是影响食管鳞癌患者预后的独立因素。结论食管鳞癌组织OTUD3表达降低，ILF2表达升高，均参与食管鳞癌肿瘤的恶性进展，是影响食管鳞癌患者预后的独立因素。