目的探讨脓毒症相关急性肾损伤（SA-AKI）患者血清组织蛋白酶B（CTSB）、长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1（lncRNA MALAT1）水平与病情严重程度的关系及其对预后的预测价值。方法选取2021年1月至2023年1月德阳市人民医院收治的80例SA-AKI患者为SA-AKI组，另选取同期80例单纯脓毒症患者为单纯脓毒症组，根据病情严重程度将SA-AKI患者分为1期（22例）、2期（27例）、3期（31例），并根据28 d临床结局分为死亡组（35例）和存活组（45例）。采用酶联免疫吸附试验和实时荧光定量PCR检测血清CTSB与lncRNA MALAT1水平，多因素Logistic回归分析SA-AKI患者预后不良的影响因素，受试者工作特征曲线分析血清CTSB、lncRNA MALAT1水平对SA-AKI患者死亡的预测价值。结果与单纯脓毒症组比较，SA-AKI组血清CTSB、lncRNA MALAT1水平升高（P<0.05）。1期、2期、3期SA-AKI患者血清CTSB、lncRNA MALAT1水平依次升高（P<0.05）。80例SA-AKI患者28 d病死率为43.75%。AKI分期3期、急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ评分、序贯器官衰竭评估评分、血乳酸、CTSB、lncRNA MALAT1升高为SA-AKI患者死亡的独立危险因素（P<0.05）。血清CTSB联合lncRNA MALAT1水平预测SA-AKI患者死亡的曲线下面积为0.894，大于血清CTSB、lncRNA MALAT1水平单独预测的0.797、0.793（P<0.05）。结论SA-AKI患者血清CTSB、lncRNA MALAT1水平升高与病情加重和预后不良密切相关，血清CTSB联合lncRNA MALAT1水平对SA-AKI患者预后的预测价值较高。