目的检测肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)和LINC00887在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）组织中的表达水平，并研究其表达水平与临床病理参数和预后的关系。方法选取2013年1月至2018年10月该院收治的101例ccRCC患者，检测TNFAIP3和LINC00887分别在ccRCC癌组织和配对的癌旁组织中的表达水平，分析TNFAIP3、LINC00887表达水平与ccRCC患者临床病理参数和预后关系，并分析ccRCC患者预后不良的影响因素。采用Spearman相关系数分析TNFAIP3、LINC00887表达水平的相关性。结果TNFAIP3在ccRCC中的阳性率（37.62%）显著低于癌旁组织（52.48%），差异有统计学意义（χ 2=4.500，P=0.034）。LINC00887在ccRCC中表达水平（1.38±0.61）显著高于在癌旁组织中的表达水平（1.03±0.43），差异有统计学意义（t=5.396，P<0.001）。TNFAIP3蛋白阳性率在肿瘤最大径≥4.5 cm、TNM分期Ⅲ～Ⅳ期患者中低于在肿瘤最大径<4.5 cm、TNM分期Ⅰ～Ⅱ期患者，差异有统计学意义（P＜0.05）。LINC00887在肿瘤最大径≥4.5 cm、病理分级Ⅲ～Ⅳ级、TNM分期Ⅲ～Ⅳ期患者中表达高于肿瘤最大径<4.5 cm、病理分级Ⅰ～Ⅱ级、TNM分期Ⅰ～Ⅱ期患者，差异有统计学意义（P＜0.05）。与TNFAIP3高表达组相比，TNFAIP3低表达组ccRCC患者预后较差，差异有统计学意义（χ 2=5.118，P=0.024）；与LINC00887低表达组相比，LINC00887高表达组ccRCC患者预后较差，差异有统计学意义（χ 2=4.638，P=0.031）。TNFAIP3低表达，LINC00887高表达，病理分级Ⅲ～Ⅳ级和TNM分期Ⅲ～Ⅳ期是ccRCC患者预后不良的危险因素（P＜0.05）。Spearman秩相关分析结果，TNFAIP3、LINC00887表达水平在ccRCC中呈负相关（r=-0.638，P=0.012）。结论ccRCC癌组织中TNFAIP3表达水平下调、LINC00887表达水平上调，且呈负相关性，二者可能共同调控ccRCC发生发展，具有成为评估ccRCC患者预后肿瘤标志物的潜力。