目的探讨肠道病毒71型手足口病（EV71-HFMD）患儿血清微小RNA（miR）-494、miR-155的表达，并分析血清miR-494、miR-155对EV71-HFMD的临床意义。方法选取2021年5月至2023年5月该院收治的145例EV71-HFMD患儿，根据病情严重程度分为轻症组（n=81）及重症组（n=64）。另选取同期73例于该院体检健康的儿童纳入健康组，检测并比较3组血清miR-494、miR-155水平及辅助性T细胞17（Th17）、调节性T细胞（Treg）及Th17/Treg。采用Pearson相关分析血清miR-494、miR-155表达水平与Th17、Treg及Th17/Treg的相关性。收集EV71-HFMD患儿的临床资料，采用多因素Logistic回归模型分析EV71-HFMD严重程度的影响因素。结果与健康组比较，轻症组及重症组血清miR-494、miR-155、Th17及Th17/Treg均升高，Treg水平降低（P＜0.05），与轻症组比较，重症组血清miR-494、miR-155、Th17及Th17/Treg均升高（P＜0.05），Treg水平降低（P＜0.05）；Pearson相关性分析显示，Th17及Th17/Treg与血清miR-494、miR-155表达水平呈正相关（P＜0.05），Treg与血清miR-494、miR-155表达水平呈负相关（P<0.05）；重症组体温峰值、发热时间≥3 d占比、咽峡部出疹均高于轻症组（P＜0.05）；多因素Logistic回归结果显示，发热时间≥3 d占比、咽峡部出疹占比、miR-494高表达及miR-155高表达是重症EV71-HFMD的危险因素（P＜0.05）。结论血清miR-494、miR-155在EV71-HFMD患儿中异常升高，二者水平变化与Th17/Treg失衡密切相关。血清miR-494、miR-155水平升高是影响重症EV71-HFMD的危险因素。