目的探讨消化道肿瘤化疗患者肠道菌群代谢产物与化疗不良反应的关系。方法选取2022年1月至2023年6月新疆医科大学附属肿瘤医院收治的消化道肿瘤化疗患者179例作为研究对象。分析患者肠道菌群代谢产物情况，并对化疗不良反应进行评价，依据化疗不良反应严重程度分级分为＜2级组和≥2级组。采用线性判别分析（LDA）及LDA效应尺寸分析组间肠道菌群差异，以及多因素Logistic回归分析化疗不良反应严重程度分级的相关因素。结果<2级组合并放疗占比、手术治疗占比及化疗次数与≥2级组比较，差异有统计学意义（P＜0.05）。<2级组乳杆菌、乳酸杆菌、敖德罗杆菌和肽链球菌相对丰度明显高于≥2级组，而柠檬酸杆菌、大肠杆菌、萨特氏菌、普氏菌、放线菌相对丰度明显低于≥2级组。≥2级组患者粪便中乙酸、丁酸水平显著低于<2级组，差异有统计学意义（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示，化疗次数、合并放疗及手术治疗是影响化疗不良反应严重程度分级的危险因素（P＜0.05），而乙酸、丁酸是影响化疗不良反应严重程度分级的保护因素（P＜0.05）。结论消化道肿瘤化疗患者肠道菌群代谢产物与化疗不良反应有关。