目的研究肝细胞肝癌（HCC）中甲基转移酶样蛋白5(METTL5)、病毒样m 6A甲基转化酶（VIRMA）的表达及与临床预后的关系。方法选取2018年3月至2021年3月就诊于该院的89例HCC患者。应用免疫组化和荧光定量PCR检测组织METTL5、VIRMA蛋白和mRNA表达。利用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析METTL5、VIRMA蛋白对HCC预后的影响。结果HCC癌组织METTL5 mRNA（3.23±0.55 vs.0.61±0.20），VIRMA mRNA（2.97±0.42 vs.0.58±0.17）高于癌旁组织，差异有统计学意义（t=42.234、49.762，均P＜0.001）。METTL5、VIRMA蛋白位于细胞质和细胞膜，部分位于细胞核。HCC癌组织METTL5 ［71.91%（64/89）vs.5.62%（5/89）］、VIRMA ［69.66%（62/89）vs.6.74%（6/89）］阳性率高于癌旁组织，差异有统计学意义（χ 2=82.385、74.627，P＜0.001，P=0.001）。HCC中METTL5、VIRMA蛋白表达与肝癌分期标准（CNLC）、肿瘤最大径及血管侵犯有关，CNLC分期Ⅱ～Ⅲ期、肿瘤最大径≥5 cm及血管侵犯的HCC癌组织中METTL5、VIRMA蛋白阳性率较高（均P＜0.05）。METTL5阳性组和阴性组3年生存率为34.88%(15/43)，67.39%(31/46)，差异有统计学意义（Log-rank χ 2=7.893，P=0.005）。VIRMA阳性组和阴性组3年生存率为36.36%(16/44)、66.67%(30/45)，差异有统计学意义(Log-rank χ 2=9.828，P=0.002）。CNLC分期Ⅱ～Ⅲ期、肿瘤最大径≥5 cm、血管侵犯、METTL5阳性、VIRMA阳性是影响HCC患者不良预后的危险因素。结论HCC中METTL5、VIRMA表达上调，均与CNLC分期Ⅱ～Ⅲ期、肿瘤最大径及血管侵犯有关，是评估HCC预后的肿瘤标志物。