目的探讨多基因风险评分（PRS）联合美国国立卫生研究院卒中量表（NIHSS）评分对缺血性脑卒中患者合并下肢深静脉血栓形成（DVT）的预测价值。方法选取2023年12月至2024年5月在吉林省人民医院住院的150例缺血性脑卒中患者作为研究对象。通过剔除不符合标准的患者，最终成功随访139例，根据是否发生DVT将其分为两组。采用PRS策略及荧光原位杂交（FISH）技术检测与静脉血栓栓塞症（VTE）风险相关的基因位点突变情况，并基于这些基因型数据及单核苷酸多态性（SNP）位点的效应大小，通过模型公式计算患者PRS评分，采用NIHSS评分评估患者的神经功能损伤程度。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析PRS评分、NIHSS评分及二者联合预测缺血性脑卒中合并下肢DVT的效能，并收集与VTE形成相关的临床资料。结果两组在性别、年龄、体重指数（BMI）、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病，以及D-二聚体（D-D）、总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）、脂蛋白(a) ［(LP(a)］水平等方面比较，差异均无统计学意义（P＞0.05）。DVT组PRS评分、NIHSS评分和Barthel指数显著高于无DVT组，且卧床时间超过72 h的患者占比和同型半胱氨酸（Hcy）水平也相对较高，差异均有统计学意义（P＜0.05）。Logistic回归分析显示，PRS评分＞2.55分、NIHSS评分≥3分及Barthel指数＜60分是影响缺血性脑卒中后发生下肢DVT的独立危险因素（P＜0.05）。ROC曲线分析结果显示，PRS评分、NIHSS评分及二者联合预测缺血性脑卒中合并下肢DVT的曲线下面积（AUC）分别为0.655、0.747、0.763，二者联合预测的AUC高于单独预测（P＜0.05）。结论PRS评分联合NIHSS评分对缺血性脑卒中合并下肢DVT具有较好的预测效能。