目的探讨乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)患者E6相关蛋白(E6AP)、BRG1基因相关因子155（BAF155）表达及临床预后意义。方法回顾性收集自2019年1月至2021年2月哈尔滨医科大学附属第一医院诊治的126例HBV-HCC患者作为研究对象。采用实时荧光定量PCR和免疫组化检测HBV-HCC患者癌组织及癌旁组织E6AP、BAF155表达。分析E6AP mRNA、BAF155 mRNA水平与HBV-HCC患者临床病理特征的关系。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线，分析E6AP mRNA、BAF155 mRNA水平对HBV-HCC患者生存预后的影响。COX回归分析影响HBV-HCC患者生存预后的因素。结果相比于癌旁组织，HBV-HCC患者癌组织E6AP mRNA和蛋白阳性率较低，而BAF155 mRNA和蛋白阳性率较高，差异有统计学意义（P<0.05）。相比于中国肝癌分期方案(CNLC)Ⅰ期、肿瘤最大径＜5 cm及HBV-DNA阴性，CNLC Ⅱ～Ⅲ期、肿瘤最大径≥5 cm 及HBV-DNA阳性的HBV-HCC癌组织中E6AP mRNA 较低，BAF155 mRNA较高，差异有统计学意义（P＜0.05）。E6AP mRNA高表达组、低表达组3年生存率为67.19% (43/64)、38.71% (24/62)，差异有统计学意义（Log rank χ 2=10.540，P=0.001）。BAF155 mRNA高表达组、低表达组3年生存率为42.62% (26/61)、63.08% (41/65)，差异有统计学意义(Log rank χ 2=6.876，P=0.009）。多因素COX分析结果显示，CNLCⅡ～Ⅲ期、BAF155 mRNA是影响HBV-HCC预后的危险因素，E6AP mRNA是其保护因素。结论HBV-HCC患者E6AP表达下调，BAF155表达上调，检测E6AP、BAF155表达有助于评估HBV-HCC患者的预后。