目的探讨人类表皮生长因子受体2（HER2）、糖类抗原199（CA199）和微管相关蛋白1轻链3β（LC3B）在胃癌组织中的表达及其与根治术后复发的关系。方法回顾性选取2021年1月至2022年12月于该院接受胃癌根治术治疗的95例患者，比较HER2、CA199和LC3B在胃癌组织及癌旁组织中的表达情况，并结合临床病理特征进行分析。根据胃癌患者术后的复发情况分为复发组（n=19）和未复发组（n=76），通过单因素分析、多因素Logistic回归分析胃癌患者根治术后复发的影响因素。结果胃癌组织中HER2、CA199和LC3B基因表达水平均高于癌旁组织，差异有统计学意义（P<0.05）。胃癌组织中HER2、CA199和LC3B阳性表达率（分别为38.95%、38.95%、35.79%）均高于癌旁组织（分别为9.47%、7.37%、11.58%），差异有统计学意义（P<0.05）。胃癌组织中HER2阳性表达率在不同TNM分期、有无淋巴结转移的胃癌患者中比较，差异有统计学意义（P<0.05），CA199和LC3B阳性表达率在不同肿瘤最大径、TNM分期、有无淋巴结转移的胃癌患者中比较，差异有统计学意义（P<0.05）。肿瘤最大径≥5 cm、TNM分期Ⅲ/Ⅳ期、有淋巴结转移、HER2阳性表达、CA199阳性表达、LC3B阳性表达均为影响胃癌患者根治术后复发的独立危险因素（P<0.05）。结论HER2、CA199和LC3B在胃癌组织中基因表达及阳性表达率高，与肿瘤最大径、TNM分期、淋巴结转移有关，且HER2、CA199、LC3B的阳性表达会增加胃癌根治术后复发的风险。