目的分析儿童肺炎支原体（MP）3种核酸检测结果，探讨MP感染的流行病学特征及不同MP核酸检测方法的特点。方法收集2018—2023年于该院就诊的有3种MP核酸检测结果的8 575例患儿为研究对象，分析不同年份、性别和年龄阳性检出率的差异及不同MP核酸检测方法阳性检出率的差异和一致性。结果2020、2021年MP阳性检出率低于2018、2019、2022、2023年（P<0.001）。男性患儿MP阳性检出率低于女性患儿（P<0.05）。6～<12岁MP阳性检出率最高，0～<3岁最低，12～<18岁和3～<6岁居二者之间，差异有统计学意义（P<0.001）。MP DNA荧光PCR法阳性检出率最高（23.15%），MP RNA恒温扩增法（12.82%）次之，MP RNA双扩增法阳性检出率最低（11.67%），差异有统计学意义（P<0.001）。MP DNA荧光PCR法与 MP RNA恒温扩增法一致性相对最好（Kappa=0.597，P<0.001），其次为MP RNA恒温扩增法和MP RNA双扩增法（Kappa=0.564，P<0.001），MP DNA荧光PCR法与 MP RNA双扩增法一致性最差（Kappa=0.466，P<0.001）。结论2020、2021年MP阳性检出率下降，6～<12岁MP阳性检出率最高，且不同MP核酸检测方法阳性检出率存在明显差异。