目的探讨上皮性卵巢癌（EOC）组织中含OTU结构域的泛素醛结合蛋白2(OTUB2)、Ⅵ型胶原蛋白A3（COL6A3）中的表达，分析二者与上皮间质转化（EMT）标志物的相关性及对EOC预后的评估价值。方法选取2019年4月至2022年4月于该院诊治的118例EOC患者为研究对象。采用实时荧光定量PCR检测组织中OTUB2 mRNA、COL6A3 mRNA表达及EMT相关基因［上皮钙黏蛋白(E-cadherin) mRNA，间质钙黏蛋白(N-cadherin) mRNA、锌指转录因子(Snail)mRNA］表达。采用免疫组织化学检测OTUB2、COL6A3蛋白表达水平。利用Pearson相关分析OTUB2、COL6A3与EMT标志物的相关性，Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险回归分析患者生存情况。结果EOC癌组织OTUB2 mRNA、 COL6A3 mRNA、 N-cadherin mRNA、Snail mRNA表达高于癌旁组织（P<0.001），E-cadherin mRNA表达低于癌旁组织（P<0.001）。癌组织中OTUB2 mRNA与N-cadherin mRNA、Snail mRNA均呈正相关（r=0.659、0.751，P＜0.001），与E-cadherin呈负相关（r=-0.691，P＜0.001）；COL6A3 mRNA与N-cadherin mRNA、Snail mRNA均呈正相关（r=0.662、0.668，P＜0.001）与E-cadherin呈负相关（r=-0.739，P＜0.001）；OTUB2 mRNA与COL6A3 mRNA呈正相关（r=0.611，P＜0.001）。癌组织OTUB2阳性率［66.10%（78/118）vs. 7.63%（9/118）］、COL6A3阳性率［67.80%（80/118）vs. 6.78%（8/118）］高于癌旁组织（χ 2=86.677、93.936，P<0.001）。与国际妇产科联盟（FIGO）分期Ⅰ～Ⅱ期、无淋巴结转移的癌组织OTUB2、COL6A3蛋白阳性率比较，FIGO分期Ⅲ期、淋巴结转移癌组织的OTUB2、COL6A3蛋白阳性率升高（P＜0.001）。OTUB2阳性组患者3年总体生存率［52.56%(41/78)vs.87.50%(35/40)］低于阴性组，COL6A3阳性组3年总体生存率［53.75%(43/80)vs.86.84%(33/38)］低于阴性组（Log-Rank χ 2=13.880、12.240，P＜0.001）。Cox比例风险回归分析结果显示，OTUB2阳性（HR=1.365、95%CI 1.104～1.687）、COL6A3阳性（HR=1.355、95%CI 1.145～1.604），FIGO分期Ⅲ期（HR=1.436，95%CI 1.085～1.901）、淋巴结转移（HR=1.270，95%CI 1.065～1.515）是影响EOC患者预后的危险因素（P＜0.001）。结论OTUB2、COL6A3在EOC中高表达，均与EMT过程密切相关，可能在EOC进展中发挥重要作用。